Gestión de Alianzas: aunque si bien su presencia no determina la ejecución del proyecto, estas pueden proporcionar recursos adicionales y apoyo logístico.

Convocatoria a escuelas: se publica, difunde y se invita a escuelas a que participen en la convocatoria.

Diagnóstico: Una vez seleccionada la escuela, el diagnóstico consiste en un análisis con todos los actores para conocer las necesidades y obstáculos específicos de la escuela, de los alumnos y de la comunidad en general (incluye aspectos como infraestructura escolar, recursos educativos, necesidades de la comunidad escolar, etc). Este diagnóstico ayudará a determinar aspectos y rubros a considerar para la idoneidad de la escuela, lo que permite planificar en conjunto las bases del presupuesto participativo escolar de acuerdo a la disponibilidad económica designada y la calendarización correspondiente.

Capacitación y diseño de proyectos: se imparten sesiones informativas para estudiantes, docentes y personal administrativo sobre qué es un presupuesto participativo, su importancia y cómo funciona. Además, se contemplan sesiones con la comunidad escolar para que transformen sus ideas en proyectos que beneficien a la escuela (pueden ser individuales o colectivos).

Dictaminación: se integra un comité conformado por representantes de estudiantes, docentes, padres de familia y personal administrativo para evaluar y seleccionar las propuestas más viables. La viabilidad considera aspectos financieros, técnicos y de impacto.

Presentación de proyectos participantes: se organiza una asamblea donde los estudiantes puedan conocer y discutir cada propuesta antes de votar.

Elección de Proyectos: se realiza un proceso de votación para elegir  el/los proyectos que serán financiados con el presupuesto participativo. Es importante involucrar a las autoridades electorales para trabajar temas de transparencia, certeza e imparcialidad.

Arranque y seguimiento: una vez seleccionado el proyecto ganador, se planteará una propuesta de inversión (cotizaciones, materiales, proveedores, montos por rubros, etc) para la aprobación de directivos y autoridades. Dicha propuesta deberá corresponder a lo solicitado por los promoventes.

Jornada de acción comunitaria: durante esta etapa se involucra a toda la comunidad escolar a formar parte directa de la ejecución del proyecto ganador (alumnado, directivos, profesorado, padres y madres de familia y personas vecinas a la escuela). 

Evaluación y rendición de cuentas: se realiza una evaluación para medir el impacto de los proyectos financiados y mantener informada a la comunidad escolar sobre el uso del recurso ejecutado por presupuesto participativo. Se realizan entrevistas con todos los actores involucrados para obtener retroalimentación y seguir escuchando las voces de los participantes.